1993年，开办中西医临床医学专业

2000年，增设中医学（中西医临床医学方向）七年制本硕连读专业

2002年，中国中西医结合学会教育工作委员会主任委员单位2002年，中西医结合临床确定为湖南省省级重点学科

2003年，教育部确认目录外专栏“中西医临床医学专业”

2003年，中西医结合系挂牌成立

2003年，被批准为博士学位授权点

2003年，附属中西医结合医院被国家中医药管理局确定为全国重点中西医结合医院建设单位

2004年，更名为中西医结合学院

2007年，被批准为中西医结合一级学科博士后科研流动站

2008年，分子病理实验室获批准为国家中医药管理局科研三级实验室

2008年，被遴选为湖南省特色专业建设点

2009年，被遴选为国家级第五批特色专业建设点

2009年，中西医结合临床课程教学团队被批准为省级优秀教学团队

2009年，中西医结合临床（心脑疾病）被批准为国家中医药管理局重点学科

2012年，中西医结合基础学科确定为湖南省省级重点学科

2012年，分子病理实验室获批准为湖南省高校重点实验室

2012年，中西医结合防治心脑疾病的相关基础研究团队批准为湖南省高校科技创新团队

2013年，中西医结合心脑疾病防治实验室被批准为湖南省重点实验室

2013年，中医药防治心脑血管疾病基础研究列入湖南省自然科学基金第一批创新研究群体

2017年，被批准为一级学科博士学位授权点

2018年，中西医结合学科被评为湖南省“双一流”建设培育学科

2019年，中西医临床医学专业获批国家一流专业建设点

2020年，开始招收中医学八年制本硕连读生（5+3一体化，卓越中西班）。

2022年，牵头成立教育部首个国家级中西医临床医学专业虚拟教研室；中西医结合一级学科第五轮学科评估获B等次。

2024年，作为全国首批高质量通过教育部中西医临床医学专业试点认证，成为全国首家通过认证的中医药院校；开设中西医临床医学专业五年制定向班与九年制本博连读（5+4一体化拔班）。